มหาวิทยาลัยศิลปากรได้ดำเนินการสูบน้ำบาดาลมาใช้ภายในมหาวิทยาลัยอย่างยั่งยืน โดยในปี พ.ศ. 2566 มีการสูบน้ำบาดาลมาใช้ปริมาณ 466,078 ลูกบาศก์เมตร นอกจากนี้ มหาวิทยาลัยยังได้ออกประกาศนโยบายการบริหารจัดการน้ำ พ.ศ. 2567 เพื่อส่งเสริมการใช้น้ำอย่างมีประสิทธิภาพและยั่งยืน